2020年8月14日,研究室在农林科学TOP期刊Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety (1区,IF:9.912)在线发表了题为“Metaproteomics insights into traditional fermented foods and beverages”的综述文章。该综述的目的是总结最近在宏蛋白质组学应用中使用的传统发酵食品和饮料的蛋白质纯化,鉴定和生物信息学技术。特别是,对宏蛋白质组学在传统发酵食品和饮料中的应用进行了综述,并为将来在传统发酵食品和饮料上的宏蛋白质组学研究提供了建议。本文旨在为读者提供进行传统发酵食品和饮料相关研究的想法。博士研究生杨亮为该论文的第一作者,徐岩教授和范文来教授为通讯作者。
传统发酵食品和饮料(TFFB)是重要的饮食成分。多组学技术已应用于TFFB研究的各个方面,以阐明TFFB的组成和营养价值,并揭示TFFB发酵过程中的微生物群落,微生物相互作用,发酵动力学和代谢特征。由于宏蛋白质组学在提供功能信息方面的优势,因此该技术已越来越多地用于评估微生物群落功能多样性的研究中。由于蛋白质组学可以揭示蛋白质水平上微生物功能的本质,因此它在TFFB研究领域逐渐受到关注。本文综述了在TFFB研究中应用的宏蛋白质组学常用方法,系统地总结了对TFFB的宏蛋白质组学研究的结果,例如酱类,葡萄酒,发酵茶,奶酪和发酵鱼;并比较了通过宏蛋白质组与其他组学方法得出的结论的差异。蛋白质组学在揭示TFFB中的微生物功能以及材料与微生物群落之间的相互作用方面具有巨大优势。将来,应将宏蛋白质组学进一步应用于TFFB中功能性蛋白质标记物和蛋白质相互作用的研究。多组学技术需要进一步整合以揭示TFFB发酵的分子特性。
上述工作得到了国家自然科学基金(No. 30530055)、国家重点研发计划 (No. 2016YFD0400503)、国家轻工技术与工程一流学科自主课题(LITE2018-12)、贵州省教育厅科技拔尖人才项目(KY [2018] 082)的资助。
论文链接:https://doi.org/10.1111/1541-4337.12601