本研究室主要针对工业生物产业中发酵工程领域和工业生物催化领域中关键科学技术问题，在研究发酵工程与生物催化技术、酿酒微生物学与微生物分子酶学的过程中，研究和发现酿造过程中重要功能微生物与关键酶、群体微生物的结构与特征，探索微生物代谢发酵途径和调控机制和酶分子改造与酶催化机理，对其中重要微生物和酶在分子水平上进行认识与改造，产业基础的发酵技术的应用，实现传统产业的改造和提升，新的工业生物催化过程与系统的建立。
近年来先后承担及参与国家重点研发计划3项、国家重点基础研究发展计划(973)项目4项、国家高技术研究发展计划(863)项目9项、国家科技支撑计划4项、国家自然科学基金（重点、面上、青年）项目30余项、泰山学者岗位计划等国家和省部级科研项目。研究成果获国家技术发明二等奖（2013）、中国专利银奖（2018）、中国商业联合会科学技术奖特等奖（2013）、中国轻工业联合会科技进步一等奖（2019、2015、2011）、教育部技术发明一等奖（2008）、江苏科技进步一等奖（2006）等省（部）级以上奖励20余项。在发酵工程、酶工程领域发表高水平SCI论文274余篇(其中1区2区文章112篇，TOP期刊82篇，封面文章11篇)，授权发明专利授权95项、其中国际专利9项，出版《发酵工程》、《现代白酒酿造微生物学》、《酶工程原理与技术》、《酒类风味化学》、《葡萄酒风味化学》、《葡萄酒酿造微生物学》、《发酵食品微生物学》、《Fermented Beverage Production (Springer)》、《Alcoholic beverages: sensory evaluation and consumer research》、《Biotechnology of Microbial Enzymes》(nova Science Publishers)等专（译）著16部。
本研究室结合国际生物技术学术前沿，围绕国家产业需求为目标开展研究。与国内知名工业生物技术企业建立合作平台和产学研合作关系，科研成果在茅台集团、五粮液集团、泸州老窖集团、山西杏花村汾酒集团、洋河集团、今世缘集团、烟台张裕葡萄酒公司、古越龙山绍兴酒公司等中国优势传统酿酒产业，夏盛实业集团、泰兴一鸣、深圳绿维康、无锡赛德等工业酶制剂产业、以及多家生物香料等食品添加剂企业中形成了明显的经济和社会效益。
研究室现有教授（研究员）10人，副教授（副研究员）6人，兼职教授3人，博士研究生、硕士研究生100余人。研究室与美国Rutgers University、University of Columbia、Oregon State University、UC Davis、瑞士Eidgenossische Technische Hochschule Zürich、法国农业科学研究院、日本京都大学等相关研究机构进行人才培养和合作研究。